Карантин был введён 24 января и первоначально планировалось завершить его около 12 февраля. Однако в ведомстве отмечали, что сроки могут быть изменены при ухудшении эпидемиологической обстановки.

В конце января Роспотребнадзор начал эпидемиологическое расследование после двух случаев внебольничной пневмонии среди постояльцев интерната для людей с психическими расстройствами в Прокопьевске. Кроме того, было выявлено 46 человек с ОРВИ и гриппом, после чего в учреждении провели дезинфекцию.

По факту произошедшего было возбуждено уголовное дело о нарушении санитарно-эпидемиологических норм, которое впоследствии переквалифицировали, поскольку в январе в интернате скончались девять постояльцев. Семь из них умерли от декомпенсации хронической сердечной недостаточности и заболеваний системы кровообращения, осложнённых нарушениями ритма и тромбозами.

Следствие установило, что распространение инфекции в учреждении произошло из-за ненадлежащего исполнения обязанностей сотрудниками интерната. Позднее выяснилось, что работники опасались сообщать о проблемах из-за угрозы увольнения.

Несмотря на смерть пациентов, интернат продолжал работать в обычном режиме, однако позже в учреждении ввели карантин. Уполномоченный по правам человека в России Татьяна Москалькова взяла расследование инцидента под свой контроль.

Глава Кемеровской области Илья Середюк потребовал провести проверку всех интернатов Кузбасса, чем занялась региональная прокуратура. Также он поручил временно отстранить от должности директора прокопьевского интерната Елену Морозову.