Соответствующий указ, вступивший в силу с 17 июня, был опубликован на официальном портале правовых актов. Согласно документу, на посты заместителей главы ведомства были назначены Анна Цивилева, Павел Фрадков и Олег Савельев. В то же время Николай Панков, Руслан Цаликов, Татьяна Шевцова и генерал армии Павел Попов были освобождены от своих должностей. Кроме того, президент РФ уволил Попова с военной службы. Согласно новому распоряжению, в Министерстве обороны РФ теперь может быть до 12 заместителей, включая двух первых, статс-секретаря – заместителя министра, заместителя министра – начальника Главного военно-политического управления Вооруженных Сил РФ и заместителя министра – руководителя аппарата ведомства. 11 июня Путин включил главу Минобороны РФ Андрея Белоусова в состав постоянных членов Совета безопасности РФ. Николай Патрушев также остался в составе Совбеза РФ в качестве помощника президента России, а Сергей Шойгу занял должность секретаря Совета безопасности. После начала нового президентского срока Путина, Сергей Шойгу был назначен секретарем Совбеза РФ. Несмотря на свое уход с поста министра обороны, Шойгу заявил, что его главной задачей по-прежнему остается обеспечение безопасности страны.