Причиной стали нарушения обязательных требований: МФТИ обвиняют в размещении неполной информации на официальном сайте, а также в несформированности и несогласованности образовательных программ. ЮФУ получил предостережение за отсутствие основной профессиональной образовательной программы магистратуры и за недостаточную открытость и доступность информации о реализуемых образовательных программах. В связи с выявленными нарушениями обеим организациям рекомендовано принять меры для соблюдения требований федерального государственного контроля в сфере образования. Ранее Рособрнадзор также направил предостережения четырём вузам: Национальному исследовательскому университету ИТМО, Московскому гуманитарно-экономическому университету, Московской международной академии и Буддийскому университету «Даши Чойнхорлин» имени Дамба Даржа Заяева, учреждению профессионального религиозного образования.